Merge version 2.16.0+ds-7+rpi1 and 2.17.0+ds-6 to produce 2.17.0+ds-6+rpi1 forky-staging archive/raspbian/2.17.0+ds-6+rpi1 raspbian/2.17.0+ds-6+rpi1
authorRaspbian automatic forward porter <root@raspbian.org>
Sun, 1 Feb 2026 14:12:53 +0000 (14:12 +0000)
committerRaspbian automatic forward porter <root@raspbian.org>
Sun, 1 Feb 2026 14:12:53 +0000 (14:12 +0000)
1  2 
debian/changelog
debian/rules

index a0b0bc9295eb56a0741f9cec0edc343282c9af0c,e64a878d08b2cf3ac0dbd3bac3dae8ca96109662..4ed5d5e37cd026e07d1972a0fde69648fef47f64
@@@ -1,9 -1,68 +1,75 @@@
- ncbi-blast+ (2.16.0+ds-7+rpi1) trixie-staging; urgency=medium
++ncbi-blast+ (2.17.0+ds-6+rpi1) forky-staging; urgency=medium
 +
 +  [changes brought forward from 2.16.0+ds-6+rpi1 by Peter Michael Green <plugwash@raspbian.org> at Sun, 12 Jan 2025 14:25:01 +0000]
 +  * Link with libatomic on armhf too.
 +
-  -- Raspbian forward porter <root@raspbian.org>  Thu, 21 Aug 2025 18:11:58 +0000
++ -- Raspbian forward porter <root@raspbian.org>  Sun, 01 Feb 2026 14:12:52 +0000
++
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-6) unstable; urgency=medium
+   * debian/patches/support_x32: Unbreak 64-bit builds.
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Fri, 17 Oct 2025 11:26:19 -0400
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-5) unstable; urgency=medium
+   * debian/patches/support_x32: Fix wgsread.cpp for 32-bit architectures.
+     (Closes: #1117023.)
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Fri, 17 Oct 2025 10:12:47 -0400
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-4) unstable; urgency=medium
+   * debian/patches/support_x32: Correctly broaden configure(.ac)'s VDB
+     allow-list.  (Closes: #1117023.)
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Thu, 16 Oct 2025 17:24:56 -0400
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-3) unstable; urgency=medium
+   * debian/control: Restrict armv8crc-support dependency to arm64.
+   * debian/patches/support_x32: Slightly broaden configure(.ac)'s VDB
+     allow-list.  (Closes: #1117023.)
+   * debian/patches/zcf-simde-crc32c: Leave CFLAGS alone on 32-bit ARM;
+     adjustments aren't actually worthwhile there and would have needed to
+     go further on armhf, on which (at least under GCC) ARMv8 targets
+     additionally need +simd.  (Closes: #1117022.)
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Thu, 16 Oct 2025 16:15:12 -0400
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-2) unstable; urgency=medium
+   * debian/control:
+     - Additionally build-depend on libsimde-dev.
+     - Require CRC support on ARM per upstream.
+   * debian/patches/zcf-simde-crc32c (new): Replace Cloudflare deflate.c's
+     fallbackless architecture-dependent code with a SIMDE invocation that
+     amounts to the same thing on supported architectures and to a portable
+     fallback elsewhere.
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Wed, 01 Oct 2025 14:43:25 -0400
+ ncbi-blast+ (2.17.0+ds-1) unstable; urgency=medium
+   * New upstream release.
+   * debian/control:
+     - Require SSE 4.2 on x86 per upstream.
+     - Reformat via "cme fix dpkg-control" (routine-update).
+   * debian/copyright:
+     - Update with more help from lrc.
+     - Clean up whitespace (routine-update).
+   * debian/ncbi-blast+.lintian-overrides: Override embedded-library zlib
+     for libzcf.so, which is Cloudflare's fork.
+   * debian/patches: Update for new release, mostly formally.
+   * debian/patches/series: Comment out support_mbedtls3, allow_pcre2,
+     and fix_bm_for_gcc15, all incorporated upstream.
+   * debian/patches/system_mbedtls_only: Drop code changes (incorporated
+     upstream) and port Makefile.connssl.lib's changes.
+   * debian/rules: Explicitly supply VDB_LIBDIR to configure to avoid a bad
+     interaction that led to spurious runpath entries in binaries linked
+     against VDB.
+  -- Aaron M. Ucko <ucko@debian.org>  Sun, 28 Sep 2025 23:08:59 -0400
  
  ncbi-blast+ (2.16.0+ds-7) unstable; urgency=medium
  
diff --cc debian/rules
Simple merge